基于Hadoop_8的新疆棉田土壤微生物资源大数据平台建设与可视化分析
【目的】本研究旨在开展新疆棉田土壤微生物资源大数据与多元异构农业资源数据间基础调查及信息的有效整合与科 学分析。【方法】根据新疆不同地区及不同成熟度的棉花种植分区，在新疆生产兵团棉花生产农业大数据平台的基础 上，建立中国典型棉田生态系统的微生物组数据库及大数据可视化分析流程。通过LEfse差异分析、RDA冗余分析等 手段，解析2017—2019年的新疆棉田土壤微生物多样性和群落结构，并采用建模等方式，实现对棉田土壤微生物资源 与多元异构农业资源数据的有效整合。【结果】建成了包含约1.7 GB的土壤微生物信息和5~6 GB环境信息的新疆棉田 土壤微生物资源数据库和土壤微生物多样性的可视化分析流程。利用该平台，经分析发现：新疆地区的特早熟棉区 （博乐、石河子、阜康），早熟棉区（奎屯），早中熟棉区（哈密）的棉田土壤细菌群落结构在门水平上变化较大，主要 类群变形菌门（Proteobacteria）占20.9~29.8%，酸杆菌门（Acidobacteria）占16.1~30.6%，疣微菌门（Verrucomi？ crobia）占8.7~28.9%，绿弯菌门（Chloroflexi）占6.6~21.2%。LEfse分析显示差异物种共计255种，其中鞘脂单胞菌 （Sphingomonadales）、脱硫杆菌（Desulfobacterales）、地杆菌（Geobacter）等是北疆棉区微生物群落结构差异的主要 物种。【结论】通过对新疆棉田土壤微生物多样性数据的收集、管理、及分析，为新疆生产兵团棉花生产农业大数据平 台的构建与应用起到了重要的支撑作用，将为我国棉田土壤微生物多样性资源的保护和利用奠定科学基础。
- 2021-06-21
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